神山（箱根山の主峰）には、箱根大神様と言われる三容の神様がいます。

その神様をお祀りしたのが今の箱根神社です。他にも箱根山中には様々な神様が祀られており、駒形神社には、駒ヶ岳の地主神、駒形大神が祀られています。
また冠ヶ岳(大涌谷)の高根神社には、「能善権現」(のうぜんごんげん)と言われていた、熊野の神が祀られており、熊野の神は“温泉の神”とも言われています。そして、芦ノ湖に九頭龍権現が祀られた九頭龍大神があります。
そのため箱根山は、その山の全体に神が宿るまさに霊山なのです。

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